Une base de données naturaliste souple et ergonomique

Bd-obs 2011

Note : Nouvelle version du 2 novembre 2011 : http://bd-obs.fr/v2/index.php
Il s’agit d’une installation de test. N’hésitez donc pas à saisir des données même fictives !

  • Le référentiel TAXREF de l’INPN est maintenant pleinement intégré, avec toutes les espèces animales et végétales du référentiel.
  • L’explorateur de données a été complétement remodelé et amélioré.
  • Le fonctionnement du module « sites et protocoles » a également été amélioré.
  • Mise en place d’un système de gestion de différents droits d’administration.
  • Fonctionnement avec les versions les plus récentes des navigateurs Firefox, Chrome, et Opéra (peut-être Safari ?), mais pas avec Internet Explorer.
  • …

Les tests effectués jusqu’à présent sont loin d’être suffisant, il y a donc certainement des bugs à corriger. Merci de me signaler ceux que vous découvrez – tr@cettia.fr

Cet outil est un logiciel libre sous licence CeCILL.

Le texte ci-dessous sera mis à jour prochainement, avec des précisions sur les prochains développements envisagés.

Aperçu de l'interface

Bd-obs est un système de base de données pour la saisie d’observations naturalistes par internet.

Cet outil peut être utilisé pour saisir, conserver et consulter ses données personnelles, mais aussi pour piloter des projets tels que des suivis de sites ou des inventaires sur un territoire quelconque.

Fonctionnalités :

Un des points forts de cet outil est la localisation des données, qui se fait par simple clic de souris sur la cartographie IGN au 1/25.000ème ou sur photos aériennes, via le géoportail qui est intégré. La couche « parcelles cadastrales » est disponible.

Plusieurs types de localisations sont automatiquement reconnus (commune, carrés 10km, 2km et 500m, éventuellement site et parcelle s’ils existent). Le géoportail permet d’enregistrer des coordonnées géographiques très précises (précision métrique) lorsque c’est utile. Une localisation par polygone (périmètre) est également possible.

Bd-obs permet de créer des « sites suivis » en utilisant le périmètre d’un espace protégé, ou en dessinant un périmètre arbitraire autour d’un espace que l’on visite régulièrement. Il est possible de définir à l’intérieur de chaque site des parcelles, caractérisées par l’homogénéité du milieu. Les sites et parcelles sont reconnus automatiquement lorsqu’on localise une donnée. Les sites peuvent être organisés en « multi-sites ».

Les sites peuvent contenir des « éléments de protocole ». Il peut s’agir de points (par exemple point d’écoute) ou de lignes (transect).

Ce système de localisation permettra de créer des cartes de répartition à différentes échelles (synthèses départementales ou régionales, répartitions précises d’une espèce à l’échelle d’un site ou d’une commune, évolution d’une répartition dans le temps). L’extraction de données est possible en une grande diversité de formats, par exemple pour injection dans un SIG ou une autre base de données, ou encore création automatisée d’une page html (synthèses).

Avancement du projet :

L’interface de saisie est fonctionnelle (reste quelques détails en cours de réalisation). Certains éléments peuvent encore être ajoutés (par exemple possibilité de localiser des interventions de gestion réalisées sur une parcelle ou sur un site). Il ne serait pas très difficile d’adapter cet outil à la saisie de données floristiques ou entomologiques. L’idéal serait probablement d’utiliser les référentiels espèces de l’INPN.

Il manque aussi un module de lecture et d’extraction de données, en cours de développement. La structuration de la base assure une grande souplesse et une large palette d’utilisation.

La base ne contient actuellement que les communes d’Ile-de-France. Certaines autres régions ou départements peuvent être ajoutés, à condition que les périmètres des communes soient disponibles (cf projet openstreetmap).

Petite contrainte, bd-obs ne fonctionne pour le moment qu’avec le navigateur Firefox à partir de la version 3.6 (la plus récente). Ce fait est lié à l’utilisation de fonctions avancées de la norme HTML5, pas encore disponible dans la plupart des navigateurs. L’outil devrait rapidement être utilisable avec Opéra, Chrome et Safari, peut-être aussi avec Internet Explorer v.9 lorsque cette version sera disponible.

Pour tester l’interface :

C’est ici : http://bd-obs.fr/v2/index.php

Il s’agit d’une installation de test, donc ne pas hésiter à saisir des données fictives et à me faire part de vos commentaires. Bd-obs est en principe très rapide, mais l’installation actuelle sur un serveur mutualisé peut occasionner quelques ralentissements à certaines heures. Une installation sur un serveur dédié optimisé pour les requêtes SQL serait plus performante.